Ofenrost auf die zweitoberste Schiene stellen und Ofen auf 190 °C vorheizen. Rindfleisch und Sojasauce in der Küchenmaschine kurz mixen, bis sie gut vermengt sind; in eine Schüssel umfüllen. Tomaten in die Küchenmaschine geben und grob zerkleinern.

Öl in einem großen Topf bei mittlerer Hitze erhitzen, bis es schimmert. Zwiebel hinzufügen und etwa 5 Minuten weich dünsten. Rindfleischmischung dazugeben und mit einem Holzlöffel zerkleinern, bis das Fleisch nicht mehr rosa ist, etwa 3 Minuten. Tomatenmark, Knoblauch und Chiliflocken unterrühren und etwa 1 Minute kochen, bis es duftet. Zerkleinerte Tomaten und Salz einrühren und etwa 25 Minuten köcheln lassen, bis die Sauce etwas eingedickt ist. Basilikum unterrühren und vom Herd nehmen.

In der Zwischenzeit 4 Liter Wasser in einem großen Topf zum Kochen bringen. Nudeln und 1 Esslöffel Salz hinzufügen und unter häufigem Rühren kochen, bis sie fast al dente sind. Nudeln abgießen und auf ein mit Küchenpapier ausgelegtes Backblech legen. 24 Muscheln beiseitelegen und beschädigte wegwerfen.

Cracker in der sauberen Küchenmaschine fein mahlen. Hüttenkäse, 1½ Tassen Mozzarella, Parmesan, Basilikum, Knoblauch und ½ Teelöffel Salz hinzufügen und zu einer glatten Masse verarbeiten. In einen großen Gefrierbeutel mit Reißverschluss füllen. Eine Ecke des Beutels mit einer Schere abschneiden und je 2 Esslöffel Füllung in jede Muschel spritzen.

Die Hälfte der Sauce in eine Auflaufform (33 x 23 cm) geben. Gefüllte Muscheln mit der Naht nach oben auf die Sauce legen. Die restliche Sauce über die Muscheln verteilen. Mit Alufolie abdecken und 35 bis 40 Minuten backen, bis es am Rand blubbert. Folie entfernen und mit dem restlichen ½ Tasse Mozzarella bestreuen. Backen, bis der Käse geschmolzen ist, etwa 5 Minuten. 10 bis 15 Minuten abkühlen lassen und servieren.